58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2219 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  90.4 
 
 		 250 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  74 
 
 		 248 aa  370  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  73.2 
 
 		 247 aa  363  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  70.4 
 
 		 247 aa  344  1e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  55.06 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  52.26 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  51.81 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  50.99 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  49.01 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  51.39 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  51 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  49 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  50.2 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  48.41 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  48.61 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  47.41 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  46.85 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  46.83 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  44.44 
 
 		 267 aa  200  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  47.13 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  47.54 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  42 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  45.16 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  45.08 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  44.58 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  34 
 
 		 387 aa  146  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  35.46 
 
 		 397 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  40.49 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  35.12 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  34.27 
 
 		 363 aa  123  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  32.93 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  32.18 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  30.46 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  26.92 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  25.38 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  32.93 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  32.93 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  25.87 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  26.69 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  27.49 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  27.49 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  27.35 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  26.64 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  31.15 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  31.65 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  26.27 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  31.21 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0843  ribosomal protein L4/L1e  31.79 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  28.32 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  26.32 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  26.25 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  28.07 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  28.24 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  28.24 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  26.07 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  24.33 
 
 		 211 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>