35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0565 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  69.92 
 
 		 248 aa  357  9e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  69.64 
 
 		 249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  68.16 
 
 		 249 aa  345  5e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  59.92 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  58.94 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  59.76 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  55.82 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  57.38 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  53.85 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  52.61 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  52.21 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  51.81 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  52.8 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  51.6 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  50 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  51.79 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  51.6 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  51.39 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  46.22 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  49 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  47.24 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  45.82 
 
 		 278 aa  192  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  44.22 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  47.01 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  46.4 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  40.89 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  40.25 
 
 		 387 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  38.46 
 
 		 363 aa  148  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  35.71 
 
 		 397 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  39.61 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  37.7 
 
 		 363 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  36.99 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  28.64 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  27.36 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>