43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51018 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  100 
 
 
397 aa  818    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  58.26 
 
 
387 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  54.97 
 
 
363 aa  364  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  56.02 
 
 
363 aa  360  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  53.35 
 
 
372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  38.25 
 
 
251 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  37.97 
 
 
281 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  37.89 
 
 
253 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  36.65 
 
 
253 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  38.52 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  38.65 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  35.86 
 
 
250 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  36.51 
 
 
267 aa  163  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  38.13 
 
 
285 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  35.46 
 
 
250 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  36.9 
 
 
249 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  35.02 
 
 
248 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  35.27 
 
 
278 aa  157  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  35.46 
 
 
247 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  35.71 
 
 
249 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  36.25 
 
 
263 aa  153  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  34.13 
 
 
248 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  33.99 
 
 
252 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  34.65 
 
 
267 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  31.87 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  34.8 
 
 
249 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  34.78 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  34.78 
 
 
254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  33.6 
 
 
252 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  32.81 
 
 
252 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  36.36 
 
 
271 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  32.94 
 
 
252 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  32.67 
 
 
247 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  24.62 
 
 
207 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>