More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1250 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  827    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  45.76 
 
 
430 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  37.53 
 
 
425 aa  245  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  37.25 
 
 
411 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  35.31 
 
 
425 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.79 
 
 
1833 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
406 aa  206  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  37.22 
 
 
450 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  36.11 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  34.15 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
412 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
439 aa  192  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  33.42 
 
 
405 aa  187  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  29.53 
 
 
397 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 
439 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  30.33 
 
 
397 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  32.41 
 
 
454 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
432 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
434 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
434 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
440 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  35.33 
 
 
1816 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  33.79 
 
 
434 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  30.39 
 
 
438 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  34.25 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
458 aa  156  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.85 
 
 
1864 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
463 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.65 
 
 
1829 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  33.43 
 
 
1769 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  35.07 
 
 
449 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  28.44 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
433 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
437 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  33.88 
 
 
449 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  28.26 
 
 
414 aa  133  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  26.27 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.75 
 
 
2720 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
409 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.62 
 
 
1876 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  27 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
499 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  26.5 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  30.87 
 
 
495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  28.14 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
432 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
432 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  28.53 
 
 
422 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  27.94 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  27.87 
 
 
422 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.68 
 
 
448 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  27.87 
 
 
422 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.87 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  28.22 
 
 
422 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.76 
 
 
1839 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
432 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.98 
 
 
422 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.28 
 
 
1776 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
433 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  30.52 
 
 
432 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.97 
 
 
441 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.2 
 
 
447 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  24.33 
 
 
441 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.67 
 
 
390 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
414 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.67 
 
 
390 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
432 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.88 
 
 
474 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  28.77 
 
 
472 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.54 
 
 
422 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.92 
 
 
1806 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  24.07 
 
 
413 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.51 
 
 
446 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
421 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.22 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.68 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.6 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.59 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.46 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.42 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 
433 aa  96.3  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.12 
 
 
412 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
414 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
433 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  21.87 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.85 
 
 
420 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.19 
 
 
413 aa  92.8  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.19 
 
 
413 aa  92.8  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  27.56 
 
 
424 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  24.07 
 
 
423 aa  92.8  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  23.61 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  25.84 
 
 
474 aa  89.7  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>