More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0013 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0013  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 
443 aa  889  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  52.64 
 
 
445 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  50.56 
 
 
448 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  51.84 
 
 
444 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0279  diaminopimelate decarboxylase  42.09 
 
 
451 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  42.73 
 
 
434 aa  339  5e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  43.19 
 
 
434 aa  338  9e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  43.88 
 
 
435 aa  338  1e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  40.91 
 
 
445 aa  337  3e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.28402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  42.03 
 
 
434 aa  336  5e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  44.71 
 
 
440 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  40.19 
 
 
447 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  41.63 
 
 
441 aa  333  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  39.71 
 
 
447 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  40.62 
 
 
434 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 
448 aa  322  1e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2425  diaminopimelate decarboxylase  42 
 
 
461 aa  321  1e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.131973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1438  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 
438 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1510  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 
438 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56168e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  38.79 
 
 
435 aa  318  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1303  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 
438 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1329  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 
438 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1302  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 
438 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 
437 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.43238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1473  diaminopimelate decarboxylase  39.33 
 
 
438 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1579  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 
438 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1542  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 
438 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0317  diaminopimelate decarboxylase  40.55 
 
 
461 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  38.42 
 
 
430 aa  313  5e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3871  diaminopimelate decarboxylase  38.85 
 
 
438 aa  313  5e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.063243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4736  diaminopimelate decarboxylase  40.09 
 
 
463 aa  312  7e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.775184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1342  diaminopimelate decarboxylase  38.37 
 
 
438 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.369143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0878  diaminopimelate decarboxylase  41.22 
 
 
465 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.109774  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 
439 aa  309  6e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0576  diaminopimelate decarboxylase  36.71 
 
 
431 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.757685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3940  diaminopimelate decarboxylase  39.95 
 
 
461 aa  305  9e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  38.83 
 
 
433 aa  305  1e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  9.40034e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10961  diaminopimelate decarboxylase  38.94 
 
 
455 aa  304  2e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297348  normal  0.231621 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1629  diaminopimelate decarboxylase  41.78 
 
 
459 aa  303  5e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46186  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0382  diaminopimelate decarboxylase  39.95 
 
 
439 aa  303  5e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0562  diaminopimelate decarboxylase  36.47 
 
 
431 aa  302  7e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0912  diaminopimelate decarboxylase  38.94 
 
 
464 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  37.71 
 
 
438 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09931  diaminopimelate decarboxylase  41.28 
 
 
455 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01670  diaminopimelate decarboxylase  38.14 
 
 
452 aa  298  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.209967  hitchhiker  5.81642e-13 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1141  diaminopimelate decarboxylase  38.13 
 
 
438 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0126  diaminopimelate decarboxylase  37.95 
 
 
474 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0123  diaminopimelate decarboxylase  37.95 
 
 
474 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.251884  normal  0.0757404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4702  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 
458 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0612  diaminopimelate decarboxylase  37.17 
 
 
436 aa  292  7e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.239326  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0771  diaminopimelate decarboxylase  37.12 
 
 
427 aa  292  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.129495  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09810  diaminopimelate decarboxylase  38.84 
 
 
462 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11811  diaminopimelate decarboxylase  36.16 
 
 
457 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1637  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 
460 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00899819  normal  0.731678 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14901  diaminopimelate decarboxylase  37.39 
 
 
454 aa  285  1e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.813083  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0842  diaminopimelate decarboxylase  38.37 
 
 
477 aa  285  1e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0309438 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11961  diaminopimelate decarboxylase  35.32 
 
 
457 aa  284  2e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0667  diaminopimelate decarboxylase  37.06 
 
 
430 aa  283  4e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00422384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2466  diaminopimelate decarboxylase  39.38 
 
 
463 aa  283  4e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.093066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1229  diaminopimelate decarboxylase  39.33 
 
 
453 aa  283  4e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0658  diaminopimelate decarboxylase  37.39 
 
 
454 aa  283  4e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0262  diaminopimelate decarboxylase  38.16 
 
 
464 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2435  diaminopimelate decarboxylase  36.3 
 
 
475 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.588454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1198  diaminopimelate decarboxylase  38.96 
 
 
465 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19350  diaminopimelate decarboxylase  38.12 
 
 
470 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.28871  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1391  diaminopimelate decarboxylase  39.73 
 
 
459 aa  280  5e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3652  diaminopimelate decarboxylase  39.46 
 
 
470 aa  279  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1791  diaminopimelate decarboxylase  40.45 
 
 
423 aa  279  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3234  diaminopimelate decarboxylase  40.09 
 
 
437 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1101  diaminopimelate decarboxylase  34.99 
 
 
457 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0732  diaminopimelate decarboxylase  38.76 
 
 
443 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11971  diaminopimelate decarboxylase  35.37 
 
 
457 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4034  diaminopimelate decarboxylase  39.91 
 
 
470 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  hitchhiker  0.00505776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5579  diaminopimelate decarboxylase  39.91 
 
 
451 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3726  diaminopimelate decarboxylase  40.09 
 
 
486 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575274  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1792  diaminopimelate decarboxylase  37.02 
 
 
459 aa  272  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4349  diaminopimelate decarboxylase  37.69 
 
 
476 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.204157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11320  diaminopimelate decarboxylase lysA (dap decarboxylase)  38.35 
 
 
447 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3883  diaminopimelate decarboxylase  37.33 
 
 
474 aa  270  3e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29281  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0629  diaminopimelate decarboxylase  39.25 
 
 
500 aa  270  3e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0587531  decreased coverage  0.000745702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3897  diaminopimelate decarboxylase  37.33 
 
 
474 aa  270  3e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3971  diaminopimelate decarboxylase  37.33 
 
 
474 aa  270  3e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1280  diaminopimelate decarboxylase  40.58 
 
 
455 aa  270  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199446  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6754  diaminopimelate decarboxylase  41.72 
 
 
423 aa  269  9e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057855  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1365  diaminopimelate decarboxylase  34.95 
 
 
423 aa  267  3e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00386973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1814  diaminopimelate decarboxylase  39.63 
 
 
426 aa  266  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.040954  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1053  diaminopimelate decarboxylase  38.94 
 
 
458 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.861814  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29970  diaminopimelate decarboxylase  37.78 
 
 
479 aa  265  9e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450757  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08010  diaminopimelate decarboxylase  39.37 
 
 
490 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.426726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1900  diaminopimelate decarboxylase  37.1 
 
 
473 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6157  diaminopimelate decarboxylase  40.04 
 
 
474 aa  263  5e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1251  diaminopimelate decarboxylase  38.59 
 
 
463 aa  262  9e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254019  normal  0.196655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4154  diaminopimelate decarboxylase  37.67 
 
 
496 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.753034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2357  diaminopimelate decarboxylase  35.66 
 
 
490 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65789e-07 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0970  diaminopimelate decarboxylase  35.08 
 
 
421 aa  252  8e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1743  diaminopimelate decarboxylase  37.67 
 
 
466 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2624  diaminopimelate decarboxylase  35.68 
 
 
500 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2093  diaminopimelate decarboxylase  36.09 
 
 
484 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000338796  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  35.08 
 
 
421 aa  246  5e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  35.08 
 
 
421 aa  246  5e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>