250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0404 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  100 
 
 
81 aa  169  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  56.58 
 
 
77 aa  100  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  48.44 
 
 
72 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  43.28 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  40.54 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  41.79 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  41.79 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  41.79 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  35.53 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.46 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  40.54 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  33.77 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  40.3 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  40.85 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  40.3 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  40.3 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  40.3 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  36.23 
 
 
80 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  40.85 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  38.03 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  36.49 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  33.8 
 
 
83 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.81 
 
 
813 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  30 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  30 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  33.8 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  33.78 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  38.03 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  40.85 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  33.75 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  36.36 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.68 
 
 
817 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  30.38 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  36.76 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  32.84 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  32.84 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.11 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.86 
 
 
831 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  29.87 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  31.17 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  36 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  33.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  34.18 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  34.29 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  32.43 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  30.67 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  42.86 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.29 
 
 
820 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  35.29 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  35.21 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  31.94 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  31.58 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  44.9 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  27.5 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  30.67 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  36 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  31.15 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  32.86 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  32.91 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  32.47 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  30.3 
 
 
200 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  32.05 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  32.81 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  42 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
354 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
354 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  30.38 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  28.75 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  32.91 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  31.88 
 
 
75 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  28.75 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  29.58 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3149  SirA family protein  29.87 
 
 
89 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0259716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  28.75 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  32.81 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  30.38 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  30.3 
 
 
189 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  28.75 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  34.33 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.43 
 
 
938 aa  51.2  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1404  SirA family protein  40.91 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  25.68 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  35.71 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  35.38 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  35.38 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  30.67 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  29.85 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  29.49 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  29.49 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  38.89 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  25.32 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  28.21 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  29.69 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  32.81 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  28.21 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>