More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0196 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 346 aa  693    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  64.95 
 
 		 311 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  41.53 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  39.6 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  38.94 
 
 		 316 aa  208  9e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  38.36 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  38.36 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  38.05 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  38.06 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  38.06 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  38.69 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  40.6 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  36.89 
 
 		 314 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  38.61 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  32.57 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  33.76 
 
 		 322 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  37.13 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  38.61 
 
 		 313 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  37.42 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  33.97 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  35.87 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  34.73 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  37.46 
 
 		 320 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  33.99 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  32.92 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  37.09 
 
 		 318 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  36.81 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  33.98 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  32.37 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  32.37 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  32.37 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  32.37 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  35.74 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  36.81 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  34 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  33.33 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  32.18 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  34.3 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  32.9 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  35.35 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  32.9 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  33.55 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  34.97 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  34.91 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  32.9 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  36.07 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  31.85 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  31.41 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  33.77 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  30.79 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  36.84 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  31.21 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  33.66 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  31.27 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  31.6 
 
 		 326 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  32.44 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  34.13 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  33.96 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  33.65 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  33.65 
 
 		 309 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  32.57 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  35.08 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.08 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  35.08 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  35.08 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  31.23 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  32.55 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  33.44 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  33.44 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  32.45 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  32.81 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  33.33 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  33.44 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  32.48 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  32.14 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  32.48 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  32.48 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  32.48 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  32.8 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  31.79 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  32.48 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  33.44 
 
 		 307 aa  149  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  31.46 
 
 		 309 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  33.55 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  32.81 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  33.11 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  34.1 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  34.65 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  31.51 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  34.32 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.12 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  33.44 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  32.36 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  33.44 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>