More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0089 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  57.36 
 
 
631 aa  712    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  53.61 
 
 
664 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  52.62 
 
 
660 aa  654    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  100 
 
 
626 aa  1285    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  54.29 
 
 
629 aa  711    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  51.33 
 
 
656 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  52.44 
 
 
651 aa  648    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  51.72 
 
 
657 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  54.1 
 
 
648 aa  680    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  52.19 
 
 
657 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  54.11 
 
 
631 aa  694    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  51.1 
 
 
656 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  70.06 
 
 
632 aa  909    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  55.13 
 
 
632 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  55.56 
 
 
629 aa  724    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  53.29 
 
 
625 aa  697    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  54.95 
 
 
629 aa  712    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  53.61 
 
 
664 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  56.83 
 
 
629 aa  725    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51.74 
 
 
652 aa  662    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.51 
 
 
655 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  51.59 
 
 
643 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  52.33 
 
 
670 aa  653    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  51.72 
 
 
660 aa  637    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53 
 
 
655 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  53.49 
 
 
627 aa  684    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  56.05 
 
 
632 aa  725    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  54.78 
 
 
635 aa  711    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.7 
 
 
660 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  50.08 
 
 
636 aa  634  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 
651 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  50.55 
 
 
655 aa  628  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.64 
 
 
656 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  50.24 
 
 
650 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.83 
 
 
649 aa  626  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  52.26 
 
 
659 aa  627  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.54 
 
 
660 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  49.53 
 
 
658 aa  624  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  50.62 
 
 
658 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.13 
 
 
660 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  50.78 
 
 
656 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.22 
 
 
660 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  50.24 
 
 
660 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  49.45 
 
 
661 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  50.71 
 
 
649 aa  621  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
652 aa  620  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 
652 aa  620  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  49.46 
 
 
657 aa  621  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  49.59 
 
 
652 aa  617  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  48.26 
 
 
649 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  49.61 
 
 
654 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  48.55 
 
 
639 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  49.05 
 
 
657 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
667 aa  615  1e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  49.03 
 
 
639 aa  615  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  50.46 
 
 
660 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  51.53 
 
 
668 aa  609  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
664 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  49.61 
 
 
660 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
660 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
660 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
660 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  49.44 
 
 
666 aa  608  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  51.4 
 
 
638 aa  611  1e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  49.2 
 
 
655 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  49.76 
 
 
658 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  50.25 
 
 
636 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 
660 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  48.57 
 
 
664 aa  605  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  49.61 
 
 
664 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  49.2 
 
 
655 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 
658 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  50.41 
 
 
636 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  49.61 
 
 
664 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 
663 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  49.11 
 
 
656 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  49.76 
 
 
657 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  48.57 
 
 
667 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  50.48 
 
 
661 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  48.41 
 
 
652 aa  605  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 
667 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  51.56 
 
 
644 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  49.15 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  49.15 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  49.15 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  48.41 
 
 
666 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  48.99 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  48.89 
 
 
667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  49.38 
 
 
660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  48.96 
 
 
655 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  49.15 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  49.15 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  49.3 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  49.15 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  51.42 
 
 
656 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  49.15 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  50.08 
 
 
636 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  52.55 
 
 
659 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  48.2 
 
 
661 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  49.38 
 
 
664 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>