More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0567 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
480 aa  946    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  57.93 
 
 
483 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  58.05 
 
 
483 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  58.86 
 
 
483 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  59.07 
 
 
483 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  59.07 
 
 
483 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  59.07 
 
 
483 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  59.07 
 
 
483 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  59.41 
 
 
481 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  59.07 
 
 
483 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  59.07 
 
 
483 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  59.07 
 
 
483 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  59.07 
 
 
483 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  57.51 
 
 
484 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  57.51 
 
 
484 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  57.51 
 
 
484 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  57.14 
 
 
483 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  58.77 
 
 
483 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  58.99 
 
 
483 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  58.99 
 
 
483 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  58.77 
 
 
483 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  58.56 
 
 
483 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  58.99 
 
 
483 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  59.2 
 
 
483 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  49.68 
 
 
492 aa  475  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  47.72 
 
 
482 aa  434  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  46.85 
 
 
495 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  47.49 
 
 
494 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  44.54 
 
 
477 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  44.49 
 
 
479 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  44.49 
 
 
479 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  44.49 
 
 
479 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  44.49 
 
 
479 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  44.54 
 
 
477 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  44.49 
 
 
479 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  44.33 
 
 
477 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  44.12 
 
 
477 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  43.91 
 
 
477 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  44.09 
 
 
487 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  45.77 
 
 
477 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  44.07 
 
 
479 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  42.4 
 
 
481 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  41.8 
 
 
483 aa  342  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  36.63 
 
 
512 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  36.48 
 
 
496 aa  299  6e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  37.73 
 
 
540 aa  286  5.999999999999999e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  32.81 
 
 
444 aa  241  1e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  29.03 
 
 
518 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  28.22 
 
 
492 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  28.02 
 
 
492 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  29.34 
 
 
497 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  28.02 
 
 
492 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.81 
 
 
493 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.81 
 
 
493 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.81 
 
 
493 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  28.36 
 
 
492 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.5 
 
 
492 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  28.35 
 
 
492 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.04 
 
 
493 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.7 
 
 
504 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.33 
 
 
492 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  28.99 
 
 
492 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  28.05 
 
 
482 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.27 
 
 
493 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.27 
 
 
487 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  28.15 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  28.27 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.33 
 
 
500 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  28.06 
 
 
492 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.34 
 
 
513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.85 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  24.12 
 
 
544 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  29.61 
 
 
498 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  29.68 
 
 
498 aa  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.88 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  29.09 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  27.64 
 
 
495 aa  140  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.13 
 
 
492 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  27.39 
 
 
499 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  28.6 
 
 
512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  28.6 
 
 
512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  27.67 
 
 
508 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.88 
 
 
485 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  28.69 
 
 
486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  28.57 
 
 
498 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.55 
 
 
483 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  26.87 
 
 
483 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.42 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  25.4 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  26.87 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  27.31 
 
 
483 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.02 
 
 
533 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.16 
 
 
484 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.82 
 
 
492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  25.51 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.6 
 
 
492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.84 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.17 
 
 
488 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  24.84 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  26.27 
 
 
483 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>