201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4933 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  100 
 
 		 407 aa  800    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  90.63 
 
 		 413 aa  687    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  83.33 
 
 		 408 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3238  hypothetical protein  95.09 
 
 		 409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.99 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  31.52 
 
 		 546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  30.56 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  37.55 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  30.25 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  39.32 
 
 		 469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  33.52 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  37.57 
 
 		 661 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  28.68 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  41.88 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  28.09 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  45.31 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  42.96 
 
 		 627 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  44.53 
 
 		 494 aa  107  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  29.82 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  36.41 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  40.85 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  30.33 
 
 		 414 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  29.14 
 
 		 526 aa  96.3  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  28.37 
 
 		 505 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  28.93 
 
 		 414 aa  86.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  27.45 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  24.33 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  23.72 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 620 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  27.95 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  25.52 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  36 
 
 		 256 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  23.8 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  26.37 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  32.33 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  23.8 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  24.8 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  26.98 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  23.91 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  23.91 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  41.35 
 
 		 620 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  23.77 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  30.6 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  30.84 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  38.28 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  25.13 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  26.25 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  27.72 
 
 		 532 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  25.87 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.12 
 
 		 530 aa  72.8  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  25.4 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  28.23 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  27.59 
 
 		 540 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  32.59 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  39.81 
 
 		 585 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  37.5 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  23.39 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  31.54 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  24.19 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  24.04 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  24.26 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  24.19 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  36.72 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  24.19 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  25.64 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  24.26 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  26.48 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  25.64 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  24.26 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  25.64 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  24.19 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  25.64 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  25.64 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  33.86 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  25.41 
 
 		 519 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  25.93 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  31.43 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  24.87 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  39.39 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  26.37 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  39.39 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  34.43 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  26.59 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  30.23 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  31.65 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  32.74 
 
 		 580 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  34.64 
 
 		 580 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  33.33 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  29.41 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  29.41 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  26.39 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  25.29 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  31.41 
 
 		 628 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  24.73 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  31.4 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  29.41 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  39.76 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  25.82 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  25.8 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>