21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3238 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3238  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  783    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  72.55 
 
 		 407 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  69.42 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  65.34 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  28.63 
 
 		 561 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  28.63 
 
 		 546 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  27.4 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  26.71 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  27.3 
 
 		 510 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  28.08 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  28.08 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  28.08 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  25.86 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  25.86 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  27.3 
 
 		 508 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  26.37 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  26.71 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  27.55 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  27.55 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  26.28 
 
 		 519 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  25.94 
 
 		 508 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>