55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4368 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  100 
 
 		 1040 aa  2035    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  51.09 
 
 		 967 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  43.58 
 
 		 928 aa  330  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4369  hypothetical protein  51.7 
 
 		 646 aa  301  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  39.04 
 
 		 695 aa  224  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  30.47 
 
 		 867 aa  208  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  32.87 
 
 		 780 aa  200  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  47.53 
 
 		 654 aa  184  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.79 
 
 		 879 aa  177  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  41.03 
 
 		 664 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  40.49 
 
 		 351 aa  152  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  34.49 
 
 		 396 aa  141  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  43.28 
 
 		 475 aa  138  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  36.92 
 
 		 595 aa  134  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  42.18 
 
 		 306 aa  134  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  34.95 
 
 		 708 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  45.12 
 
 		 407 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.73 
 
 		 846 aa  121  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  37.15 
 
 		 322 aa  117  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  29.58 
 
 		 686 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  28.41 
 
 		 699 aa  115  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  42.24 
 
 		 316 aa  115  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  40.91 
 
 		 892 aa  112  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  30.41 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  30.41 
 
 		 754 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  30.41 
 
 		 706 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  36.19 
 
 		 617 aa  97.8  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 399 aa  91.3  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  36.97 
 
 		 546 aa  89.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  80.9  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  42.31 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  32.68 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  26.91 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  30.92 
 
 		 1022 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  26.55 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  26.1 
 
 		 653 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  37.25 
 
 		 312 aa  66.6  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  27.52 
 
 		 601 aa  67  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  37.23 
 
 		 186 aa  64.3  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  29.08 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  34.78 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  37.17 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  37.17 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  37.17 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0282  hypothetical protein  26.29 
 
 		 767 aa  57.4  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.14346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  36.36 
 
 		 582 aa  55.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  22.54 
 
 		 662 aa  55.8  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  29.37 
 
 		 560 aa  54.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  35.64 
 
 		 539 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 539 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  30.41 
 
 		 1027 aa  52.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  34.51 
 
 		 541 aa  52  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  31 
 
 		 370 aa  48.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0210  putative esterase  40 
 
 		 475 aa  46.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2546  hypothetical protein  30.33 
 
 		 270 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>