More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0400 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0400  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 329 aa  649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0735  putative glycosyltransferase protein  52.62 
 
 		 368 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0416  glycosyl transferase family 2  54.46 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  37.61 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4552  cyclic nucleotide-binding protein  35.55 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1821  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4544  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.27 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4102  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3627  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  45.54 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  46.53 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 359 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.62 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  50.98 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 1035 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 235 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  42 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0668  glycosyl transferase family 2  48.91 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.34 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0351  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  45.26 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 397 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  44 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  40 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0591  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.93 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 597 aa  76.6  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  41.28 
 
 		 1169 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  36.26 
 
 		 746 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  45.92 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  32.46 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  36.56 
 
 		 970 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 544 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  31.43 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  43 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  35.92 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  44.57 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  34.95 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  34.95 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 		 672 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  36.91 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  36.89 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  36.89 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 701 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  36.89 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  36.89 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  26.63 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  34.95 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  36.89 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  29.85 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0352  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  41.94 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  36.89 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  35.92 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  34.95 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>