60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2546 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  67.11 
 
 		 834 aa  1125    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 838 aa  1643    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  47.66 
 
 		 541 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  47.86 
 
 		 541 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  48.07 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  47.45 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  36.82 
 
 		 885 aa  255  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  36.35 
 
 		 925 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  35.28 
 
 		 893 aa  229  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  36.49 
 
 		 632 aa  225  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  32.96 
 
 		 966 aa  188  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  35.45 
 
 		 979 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  32.97 
 
 		 879 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  32.62 
 
 		 879 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  32.97 
 
 		 879 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  33.66 
 
 		 904 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  44.44 
 
 		 930 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  27.74 
 
 		 682 aa  100  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  39.83 
 
 		 841 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  29.34 
 
 		 899 aa  97.4  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  29.51 
 
 		 738 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  26.79 
 
 		 731 aa  93.6  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  31.03 
 
 		 892 aa  91.3  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  30.72 
 
 		 760 aa  87.4  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  30.74 
 
 		 712 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  30.74 
 
 		 712 aa  87.4  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  30.74 
 
 		 712 aa  87.4  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  25.93 
 
 		 739 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  30.74 
 
 		 720 aa  86.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  32.07 
 
 		 759 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  30.07 
 
 		 716 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  30.04 
 
 		 712 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  34.65 
 
 		 755 aa  82.4  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  38.46 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  39.38 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  31.73 
 
 		 765 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.99 
 
 		 575 aa  78.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  36.42 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4213  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.936932  normal  0.431658 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7053  hypothetical protein  45.83 
 
 		 102 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.496846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1537  hypothetical protein  45.74 
 
 		 103 aa  67  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  32.82 
 
 		 845 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7732  hypothetical protein  52.46 
 
 		 102 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  35.29 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  29.94 
 
 		 815 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  24.29 
 
 		 732 aa  55.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  25.84 
 
 		 610 aa  54.3  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  36.79 
 
 		 718 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  26.3 
 
 		 597 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  23.75 
 
 		 701 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3114  hypothetical protein  34.58 
 
 		 933 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  30.72 
 
 		 895 aa  48.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  35.51 
 
 		 277 aa  48.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  46.15 
 
 		 610 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  38.67 
 
 		 788 aa  47  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  50.88 
 
 		 344 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0967  hypothetical protein  31.78 
 
 		 933 aa  47  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  26.24 
 
 		 590 aa  45.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  25.53 
 
 		 654 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  28.66 
 
 		 867 aa  44.3  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>