10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3114 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0967  hypothetical protein  80.67 
 
 		 933 aa  1562    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2198  hypothetical protein  81.05 
 
 		 934 aa  1567    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4874  zinc finger CHC2-family protein  49.73 
 
 		 931 aa  870    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0337789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0166  zinc finger CHC2-family protein  49.09 
 
 		 930 aa  852    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3114  hypothetical protein  100 
 
 		 933 aa  1933    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  25.14 
 
 		 548 aa  51.6  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  21.65 
 
 		 596 aa  48.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  34.26 
 
 		 407 aa  47.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  28.22 
 
 		 639 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  23.65 
 
 		 572 aa  45.1  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>