More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0801 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  863    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
432 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
429 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
435 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  32.85 
 
 
412 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  31.96 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  32.01 
 
 
418 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  29.6 
 
 
420 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.69 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.54 
 
 
420 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.27 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.27 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.92 
 
 
420 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.52 
 
 
420 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  26.68 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.92 
 
 
420 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
459 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
409 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  30.67 
 
 
431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  31.07 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
410 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.19 
 
 
390 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.19 
 
 
390 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  24.14 
 
 
415 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  26.15 
 
 
422 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.14 
 
 
415 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.14 
 
 
415 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.14 
 
 
415 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
429 aa  100  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.14 
 
 
415 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.14 
 
 
415 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.14 
 
 
415 aa  100  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  26.8 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  26.8 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.97 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.14 
 
 
415 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.25 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.43 
 
 
1833 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
420 aa  97.8  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 
433 aa  96.7  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.64 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  32.87 
 
 
420 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.67 
 
 
418 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  24.38 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.14 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
455 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.94 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
415 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
444 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.78 
 
 
405 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
439 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.34 
 
 
447 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.78 
 
 
405 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
423 aa  87  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 
432 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
420 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  24.21 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.48 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.03 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.79 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.21 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  32.77 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  28.68 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.96 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
414 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.06 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.81 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  35.58 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  21.99 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.55 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.55 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.85 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.91 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.9 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.74 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.29 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.55 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  35.1 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.44 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  25.77 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  25.77 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  23.83 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  26.03 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.83 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>