More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3921 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  82.14 
 
 		 590 aa  991    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  87.93 
 
 		 591 aa  1054    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  53.83 
 
 		 602 aa  637    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  52.6 
 
 		 610 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  89.71 
 
 		 593 aa  1077    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  53.65 
 
 		 597 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  55.39 
 
 		 597 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  86.56 
 
 		 591 aa  1042    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  52.02 
 
 		 597 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  55.46 
 
 		 592 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 		 593 aa  1215    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  56.13 
 
 		 594 aa  651    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  56.83 
 
 		 619 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  54.71 
 
 		 607 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  53.95 
 
 		 604 aa  645    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  55.05 
 
 		 597 aa  643    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  96.63 
 
 		 593 aa  1162    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  54.71 
 
 		 607 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  52.87 
 
 		 590 aa  629  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  54.03 
 
 		 603 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  52.02 
 
 		 597 aa  630  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  53.78 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  53.99 
 
 		 624 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  55.37 
 
 		 619 aa  618  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  53.23 
 
 		 600 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  50.93 
 
 		 636 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  55.72 
 
 		 596 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  55.75 
 
 		 598 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  51.01 
 
 		 636 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  50.67 
 
 		 614 aa  612  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  52.61 
 
 		 595 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  52.14 
 
 		 627 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  53.26 
 
 		 617 aa  611  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  50.93 
 
 		 594 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  51.68 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  51.83 
 
 		 629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  50.92 
 
 		 626 aa  599  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  50.33 
 
 		 620 aa  599  1e-170  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  50.67 
 
 		 656 aa  600  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  49.08 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  50.85 
 
 		 677 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  48.49 
 
 		 640 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  50.25 
 
 		 588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.99 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  50.08 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  49.33 
 
 		 623 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.92 
 
 		 623 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  49.92 
 
 		 641 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  49.83 
 
 		 604 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  49.24 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  56.85 
 
 		 485 aa  569  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  49.09 
 
 		 634 aa  571  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  49.25 
 
 		 632 aa  569  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  48.99 
 
 		 626 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  48.83 
 
 		 623 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  48.42 
 
 		 624 aa  567  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  49.17 
 
 		 624 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  48.76 
 
 		 626 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  48.59 
 
 		 626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  50.95 
 
 		 552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  50.93 
 
 		 562 aa  559  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  53.96 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  53.96 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 612 aa  558  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  53.54 
 
 		 486 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  52.81 
 
 		 488 aa  555  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  49.08 
 
 		 572 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  54 
 
 		 572 aa  548  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  54.05 
 
 		 488 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  51.04 
 
 		 535 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  48.74 
 
 		 597 aa  541  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  48.68 
 
 		 628 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  48.39 
 
 		 570 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  53.81 
 
 		 526 aa  533  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  54.04 
 
 		 537 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  51.97 
 
 		 575 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  51.57 
 
 		 569 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  51.54 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  50.96 
 
 		 530 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  51.82 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  50.78 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  50.58 
 
 		 535 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  52.99 
 
 		 532 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.54 
 
 		 569 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  51.9 
 
 		 562 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  53.64 
 
 		 668 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  48.47 
 
 		 534 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  50.46 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  48.64 
 
 		 570 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  46.55 
 
 		 572 aa  485  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 		 545 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  44.54 
 
 		 620 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  45.47 
 
 		 580 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  45.54 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  45.66 
 
 		 562 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  41.73 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  42.96 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  41.54 
 
 		 538 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  49.03 
 
 		 407 aa  432  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>