124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0724 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  84.59 
 
 		 303 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  93.06 
 
 		 300 aa  477  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 325 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  45.67 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  44.72 
 
 		 640 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  43.82 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  42.56 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  47.37 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  39.86 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  41.3 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  42.01 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  42.01 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.7 
 
 		 336 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  41.67 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  41.34 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  39.72 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  38.65 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  39.18 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.96 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.19 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  39.18 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  33.45 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.73 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.13 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.65 
 
 		 584 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  45.3 
 
 		 120 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  27.37 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.09 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  26.79 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  27.78 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  27.78 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  28.18 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.27 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  29.56 
 
 		 348 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  31.07 
 
 		 642 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 642 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  27.27 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 642 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  27.93 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  25.63 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  25.63 
 
 		 311 aa  45.8  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>