More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0605 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 324 aa  634    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  95.37 
 
 		 323 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  58.28 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  55.21 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  54.29 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  49.69 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  48.17 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  50.76 
 
 		 329 aa  262  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  41.62 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  41.77 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  41.46 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  41.72 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  42.2 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  41.69 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  39.94 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  38.67 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  38.41 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  39.29 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  40.92 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  40.31 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  36.84 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  38.44 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  39.58 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  39.76 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.43 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  40.24 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  41.1 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  41.11 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  41.1 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  40.73 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.43 
 
 		 318 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  40.8 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  37.72 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  38.66 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  38.7 
 
 		 354 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  39.32 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  39.32 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  44.21 
 
 		 319 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  42.2 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  39.82 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  39.42 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  41.28 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  35.88 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  42.38 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  40.18 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  41.96 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  41.28 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  41.28 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  41.28 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  36.67 
 
 		 314 aa  192  9e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  39.02 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  40.12 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  42.25 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  40.53 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  40.91 
 
 		 317 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  41.49 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  42.94 
 
 		 321 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 332 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  36.77 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  35.93 
 
 		 339 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  41.18 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  40.18 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  40.73 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  43.08 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  39.64 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  36.45 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  36.59 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  34.51 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  37.31 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  36.08 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  39.57 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  40.67 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  42.01 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  39.88 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  40.06 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  41.77 
 
 		 361 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  39.57 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  37.96 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  39.57 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  39.57 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  39.57 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  39.57 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  39.26 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  39.46 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  41.59 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  39.57 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  39.57 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  39.57 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>