More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0097 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  94.94 
 
 		 425 aa  729    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  834    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  68.27 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  65.95 
 
 		 418 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  61.98 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  50.49 
 
 		 414 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 445 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 395 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  28.41 
 
 		 426 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  26 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  26 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  28.12 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 390 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  28.73 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 443 aa  126  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 413 aa  126  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  26.98 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  27.87 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  27.32 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  31.42 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.54 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.31 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  27.86 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  26.3 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  26.3 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  29.27 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  33.07 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  26.21 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  28.68 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  28.29 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 443 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 442 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  27.32 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  24.8 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  28.27 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  20.83 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  21.38 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  26.54 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  26.54 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  26.54 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  23.41 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 446 aa  99.8  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  23.55 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.14 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  23.7 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  22.63 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>