60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0627 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 368 aa  747    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2593  HK97 family phage major capsid protein  43.64 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  43.19 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2624  phage major capsid protein, HK97 family  38.62 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  38.56 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0012  phage major capsid protein, HK97 family  33.42 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  35.94 
 
 		 506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1459  phage major capsid protein, HK97 family  26.87 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1645  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  29.84 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  24.43 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  23.62 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  24.06 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  25.19 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  25.71 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  23.1 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  24.82 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1584  HK97 family phage major capsid protein  28.08 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0506282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  21.68 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  23.75 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  25.19 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  23.02 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  27.68 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  22.07 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.21 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  21.5 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  26.1 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  22.87 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  25 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  24.63 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  20.66 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  22.34 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  23.05 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  23.74 
 
 		 471 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  24.1 
 
 		 417 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2956  phage major capsid protein, HK97 family  25.33 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  21.85 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.33 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  26.92 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  25.86 
 
 		 405 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  24.02 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  24.54 
 
 		 450 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  35.09 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  21.81 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  22.71 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  22.73 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  23.51 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  22.91 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  19.03 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  22.54 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  26.83 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  25.93 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  24.91 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  23.29 
 
 		 420 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  23.82 
 
 		 424 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  20.97 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  22.73 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  22.22 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  23.7 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  24.79 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  21.22 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>