More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0214 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
364 aa  738    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  75.55 
 
 
364 aa  584  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.94 
 
 
366 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.67 
 
 
366 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.67 
 
 
366 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.39 
 
 
366 aa  512  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.67 
 
 
366 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.94 
 
 
366 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.67 
 
 
366 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.67 
 
 
366 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  65.84 
 
 
366 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.67 
 
 
366 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  65.84 
 
 
366 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  56.51 
 
 
365 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  57.06 
 
 
364 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.74 
 
 
368 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  56.91 
 
 
365 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  58.08 
 
 
367 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  56.32 
 
 
366 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  54.02 
 
 
366 aa  391  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.87 
 
 
360 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.09 
 
 
363 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.09 
 
 
363 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.93 
 
 
360 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.38 
 
 
360 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.83 
 
 
360 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.72 
 
 
363 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  52.49 
 
 
370 aa  360  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.62 
 
 
363 aa  360  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  48.08 
 
 
371 aa  359  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  46.93 
 
 
357 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  51.66 
 
 
371 aa  349  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.66 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  46.13 
 
 
360 aa  341  9e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  48.91 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  51.67 
 
 
369 aa  339  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.95 
 
 
381 aa  338  5.9999999999999996e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.99 
 
 
376 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  45.03 
 
 
360 aa  333  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  50.82 
 
 
372 aa  331  9e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.41 
 
 
359 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  49.72 
 
 
361 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.15 
 
 
369 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  47.43 
 
 
375 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  46.44 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.58 
 
 
441 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.87 
 
 
372 aa  323  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.73 
 
 
362 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  48.91 
 
 
375 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.42 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.41 
 
 
364 aa  318  9e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  47.93 
 
 
351 aa  317  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.47 
 
 
380 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  43.41 
 
 
364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.13 
 
 
369 aa  312  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.26 
 
 
369 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.26 
 
 
369 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.97 
 
 
374 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  47.12 
 
 
364 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  44.26 
 
 
378 aa  308  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.75 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.04 
 
 
430 aa  305  6e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  48.75 
 
 
350 aa  305  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.37 
 
 
362 aa  305  9.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.96 
 
 
363 aa  302  5.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.32 
 
 
375 aa  301  9e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  44.05 
 
 
381 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.67 
 
 
372 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  43.96 
 
 
357 aa  298  8e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  44.11 
 
 
369 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.4 
 
 
372 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.6 
 
 
372 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.75 
 
 
381 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.48 
 
 
370 aa  296  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.87 
 
 
365 aa  296  5e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.92 
 
 
366 aa  295  6e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.26 
 
 
362 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 
403 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.08 
 
 
362 aa  292  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  42.15 
 
 
361 aa  290  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  47.38 
 
 
374 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.48 
 
 
365 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  43.8 
 
 
363 aa  289  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  42.23 
 
 
401 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  46.58 
 
 
363 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.41 
 
 
365 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 
360 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.75 
 
 
365 aa  279  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 
360 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  42.9 
 
 
379 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  42.86 
 
 
391 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  41.64 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  43.09 
 
 
365 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.53 
 
 
379 aa  272  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.55 
 
 
363 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  41.55 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.81 
 
 
365 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  45.04 
 
 
386 aa  269  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0338  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.09 
 
 
363 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368876  normal  0.123109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  45.14 
 
 
372 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>