More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1893 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 321 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  83.18 
 
 		 321 aa  534  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  81.31 
 
 		 321 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  74.53 
 
 		 322 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  74.53 
 
 		 322 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  73.52 
 
 		 321 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  71.88 
 
 		 322 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  68.34 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  57.05 
 
 		 324 aa  361  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  58.93 
 
 		 329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  55.45 
 
 		 320 aa  355  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  55.45 
 
 		 320 aa  355  5e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  54.86 
 
 		 324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  56.37 
 
 		 339 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  53.61 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  54.43 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  54.23 
 
 		 324 aa  345  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  54.29 
 
 		 323 aa  345  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  53.92 
 
 		 324 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  54.23 
 
 		 324 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  53.92 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  55.94 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.78 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  57.51 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  53.92 
 
 		 324 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  54.26 
 
 		 321 aa  342  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  53.29 
 
 		 323 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  55.87 
 
 		 326 aa  341  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  53.77 
 
 		 344 aa  341  9e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.18 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  55.49 
 
 		 326 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  57.46 
 
 		 330 aa  338  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  51.56 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  53.14 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  53.92 
 
 		 345 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  53.92 
 
 		 345 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  53 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  59.06 
 
 		 326 aa  335  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  54.55 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  57.05 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  57.01 
 
 		 341 aa  332  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  48.9 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  53.46 
 
 		 323 aa  332  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  53.18 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  53.53 
 
 		 333 aa  331  8e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  52.85 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.68 
 
 		 357 aa  329  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  53.02 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  52.52 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.68 
 
 		 342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  53.18 
 
 		 324 aa  328  6e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.68 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  58.1 
 
 		 328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  52.55 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.59 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  52.23 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.74 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  51.57 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  52.88 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  55.59 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  48.59 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  51.89 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  51.59 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  51.59 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  51.59 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  51.59 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  54.43 
 
 		 333 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  53.99 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  53.99 
 
 		 327 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 		 319 aa  322  6e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  50.62 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 325 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  53.35 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  55.89 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  54.81 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.1 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  55.89 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  55.59 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  51.27 
 
 		 325 aa  319  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  54.52 
 
 		 338 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 323 aa  318  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  55.21 
 
 		 335 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  51.57 
 
 		 325 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  49.53 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  51.26 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  54.31 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.27 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  51.92 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>