59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3144 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  351  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  88.76 
 
 		 178 aa  304  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  36.94 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  36.03 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  31.65 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  32.89 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  32.89 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  32.89 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  32.89 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  32.89 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  32.89 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  32.89 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  27.98 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  32.89 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  29.59 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  31.13 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  30.52 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  29.66 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  30 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  29.53 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  30.97 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  32.89 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  32.71 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  29.01 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  27.95 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  30.3 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  29.01 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  29.01 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  29.75 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  31.86 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  31.21 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  28.48 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  30.09 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  29.9 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  25.33 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  25.31 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  28.97 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  31.31 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  29.45 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1916  hypothetical protein  31.72 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  29.27 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2312  hypothetical protein  31.43 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  31.43 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  27.81 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  27.74 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  29.2 
 
 		 174 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2300  protein of unknown function, Spy-related  30.3 
 
 		 147 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000365275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  29.2 
 
 		 174 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0090  hypothetical protein  28.09 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00936668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2224  hypothetical protein  29.69 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.447123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>