34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2222 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  38.28 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  33.95 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  36.04 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  30.48 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  32.65 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  31.48 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1544  hypothetical protein  32.61 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.78 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.78 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.78 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  24.82 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  30.99 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  30.99 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  30.99 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  30.99 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  30.99 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2300  protein of unknown function, Spy-related  31.76 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000365275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  25.9 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  27.18 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  27.63 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  28.03 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  27.7 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  27.7 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  27.7 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  27.7 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  27.7 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2387  hypothetical protein  25.97 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  27.7 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  28.37 
 
 		 166 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  28.37 
 
 		 166 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  50 
 
 		 166 aa  42  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>