30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2312 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2312  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  98.91 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  91.33 
 
 
184 aa  330  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  90.75 
 
 
184 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  90.75 
 
 
184 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  88.44 
 
 
182 aa  314  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0888  hypothetical protein  87.86 
 
 
186 aa  308  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1093  hypothetical protein  72.53 
 
 
232 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0749  hypothetical protein  71.98 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1575  hypothetical protein  71.98 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1098  hypothetical protein  71.98 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.388443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3022  hypothetical protein  71.98 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0547745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0992  hypothetical protein  71.98 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1251  hypothetical protein  71.98 
 
 
181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0892  hypothetical protein  67.58 
 
 
181 aa  184  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3388  hypothetical protein  70.54 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1124  hypothetical protein  68.99 
 
 
176 aa  179  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2161  hypothetical protein  63.33 
 
 
182 aa  175  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157961  hitchhiker  0.00000108791 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  31.07 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  32.35 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  31.68 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  31.68 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  30.69 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  31.43 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  28.43 
 
 
314 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  26.92 
 
 
197 aa  41.2  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  29.41 
 
 
171 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>