28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2447 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2312  hypothetical protein  98.91 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  91.33 
 
 		 184 aa  330  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  90.75 
 
 		 184 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  90.75 
 
 		 184 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  88.44 
 
 		 182 aa  314  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0888  hypothetical protein  89.02 
 
 		 186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1093  hypothetical protein  72.53 
 
 		 232 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0749  hypothetical protein  71.98 
 
 		 181 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1575  hypothetical protein  71.98 
 
 		 181 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1098  hypothetical protein  71.98 
 
 		 181 aa  213  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.388443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0992  hypothetical protein  71.98 
 
 		 181 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3022  hypothetical protein  71.98 
 
 		 181 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0547745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1251  hypothetical protein  71.98 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3388  hypothetical protein  72.09 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0892  hypothetical protein  67.58 
 
 		 181 aa  185  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1124  hypothetical protein  70.54 
 
 		 176 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2161  hypothetical protein  62.78 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157961  hitchhiker  0.00000108791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  30.1 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  31.37 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  31.37 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  31.37 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  30.39 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  31.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  29.7 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  29.7 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  28.71 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  26.92 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>