30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2113 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  46.23 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  35.56 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  41.58 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  45.63 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  44.68 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  44.57 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  39.02 
 
 
125 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  39.02 
 
 
95 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  40.86 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  40.86 
 
 
178 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  37.11 
 
 
314 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  38 
 
 
178 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  41.94 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  41.94 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  41.94 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  40.82 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  37.11 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  37.11 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  41.33 
 
 
533 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  28.71 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  30.25 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  27.34 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  26.9 
 
 
209 aa  42  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  27.64 
 
 
183 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  30.17 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  30.17 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  30.17 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2312  hypothetical protein  27.64 
 
 
183 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  26.21 
 
 
209 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.906518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>