44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2145 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  98.83 
 
 
314 aa  340  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  98.83 
 
 
171 aa  338  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  69.33 
 
 
178 aa  200  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  73.15 
 
 
178 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  71.24 
 
 
180 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  68.67 
 
 
180 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  68.67 
 
 
180 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  69.28 
 
 
183 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  68.42 
 
 
181 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  59.57 
 
 
172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  51.81 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  55.56 
 
 
171 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  39.86 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  45.19 
 
 
179 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  40.34 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  45.05 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  60.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  38.71 
 
 
197 aa  58.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  39.78 
 
 
106 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  27.03 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  34.69 
 
 
209 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  37.78 
 
 
179 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0888  hypothetical protein  27.54 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  30 
 
 
230 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  36.17 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0582  hypothetical protein  27.19 
 
 
222 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  34.62 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  32.22 
 
 
280 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  26.47 
 
 
221 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  28.81 
 
 
241 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2312  hypothetical protein  27.52 
 
 
183 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  29.22 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  26.17 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  29.9 
 
 
210 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  26.67 
 
 
231 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3388  hypothetical protein  27.18 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1124  hypothetical protein  27.72 
 
 
176 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  30.93 
 
 
199 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  26.17 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  26.17 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  26.17 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  28.89 
 
 
199 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>