23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2343 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  84.16 
 
 		 199 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  61.5 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  71.76 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  38.84 
 
 		 152 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  38.84 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  37.1 
 
 		 155 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  37.21 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  35.65 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  38.24 
 
 		 179 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  39.62 
 
 		 177 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  45.9 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  32.08 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  45.9 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  39.42 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  48.21 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  35.24 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  28.79 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0582  hypothetical protein  29.25 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  26.71 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  32 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>