35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2997 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 
179 aa  347  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  71.11 
 
 
177 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  42.78 
 
 
196 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  40.54 
 
 
192 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  47.97 
 
 
205 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  40.48 
 
 
209 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  46.51 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  50 
 
 
221 aa  91.7  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  50.94 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  48 
 
 
210 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  44.83 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  48.31 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  43.48 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  36.77 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  31.61 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  41.94 
 
 
152 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  39.32 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  32.77 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  35.95 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  38.46 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  35.92 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  38.24 
 
 
241 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  36.63 
 
 
280 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  36.56 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  31.03 
 
 
95 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  31.03 
 
 
125 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  36.56 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  36.84 
 
 
314 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3742  hypothetical protein  31.78 
 
 
221 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.83109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2676  hypothetical protein  32.71 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  32.73 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0710  hypothetical protein  32.32 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  29.85 
 
 
218 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  32.61 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  30.91 
 
 
181 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>