24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3231 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  63.79 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  71.6 
 
 		 199 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  59.56 
 
 		 196 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  65.12 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  66.86 
 
 		 211 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  68.59 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  49.3 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.87 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  53.64 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  44.74 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  38.78 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  43.31 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  32.45 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  31.93 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  40.62 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  33.13 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  35.85 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  30.86 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  30.26 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  28.42 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2676  hypothetical protein  30.17 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>