23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4116 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  61.86 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  64.25 
 
 		 199 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  57.38 
 
 		 280 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  35.83 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  38.39 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  30.94 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  29.27 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  27.69 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  33.96 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  26.53 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  35.92 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  35.45 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  34.31 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  34.26 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  37.78 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  46.94 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  51.16 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  46.94 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  35.51 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>