23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2714 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  396  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  78.72 
 
 		 192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  61.45 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  59.56 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  57.22 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  56.5 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  57.23 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.03 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  43.48 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  40.13 
 
 		 165 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  42.86 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  45.3 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  38.41 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  30.38 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  34.23 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  32.43 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  29.37 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  31.97 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  30.83 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  33.93 
 
 		 280 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  32.14 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  27.14 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  29.7 
 
 		 162 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>