44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5590 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  340  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  71.11 
 
 
179 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  45.36 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  42.78 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  53.79 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  45.73 
 
 
209 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  48.73 
 
 
199 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  52.83 
 
 
165 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  46.75 
 
 
185 aa  97.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  48.23 
 
 
210 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  38.17 
 
 
221 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  45.19 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  48.08 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  42.07 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  40.29 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  40.86 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  36.97 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  39.39 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  38.68 
 
 
171 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  35.77 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  37.72 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  40.43 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2676  hypothetical protein  34.82 
 
 
217 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  37.35 
 
 
95 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  38.46 
 
 
280 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  37.35 
 
 
125 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  36.17 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  39.62 
 
 
241 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  35.11 
 
 
171 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  35.42 
 
 
314 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3742  hypothetical protein  34.55 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.83109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  35.59 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  36.17 
 
 
171 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  35.51 
 
 
219 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  33.98 
 
 
106 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  33.03 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  34.44 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  32.2 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  29.1 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0710  hypothetical protein  28.97 
 
 
243 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>