28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2938 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  58.73 
 
 		 241 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  70.34 
 
 		 199 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  57.32 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  38.02 
 
 		 152 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  38.57 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  38.02 
 
 		 152 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  28.38 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  33.93 
 
 		 196 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  40.38 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  37.62 
 
 		 165 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  33.02 
 
 		 209 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  36.63 
 
 		 179 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  36.84 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  44.44 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  47.06 
 
 		 148 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  31.25 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  37.63 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  39.08 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.8 
 
 		 1888 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  29.01 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  38.2 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>