16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1811 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  38.62 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  35.83 
 
 		 152 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  27.14 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  29.57 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  28.38 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  27.72 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  26.71 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  29.44 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  32.07 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  31.58 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  26.14 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  34.58 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  25.34 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.34 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>