26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2263 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  57.98 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  56.28 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  68.93 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  72.29 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  73.08 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  58.77 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  51.63 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  49.3 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  51.82 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  52.14 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  43.84 
 
 		 165 aa  95.5  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  43.71 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  34.27 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  34.51 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  33.64 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  42.27 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  39.42 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  39.18 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  33.57 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2676  hypothetical protein  33.04 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  32.11 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3742  hypothetical protein  31.86 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.83109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  28.19 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>