27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2337 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  79.79 
 
 
196 aa  284  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  63.79 
 
 
185 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  62.28 
 
 
199 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  58.9 
 
 
205 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  57.3 
 
 
211 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  56.49 
 
 
210 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  46.3 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  43.67 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  45.07 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  41.18 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  42.5 
 
 
209 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  41.43 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  29.75 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  36.97 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  33.77 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  33.11 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  29.23 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  32.74 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  31.21 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  28.46 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  29.77 
 
 
280 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  31 
 
 
95 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  29.01 
 
 
241 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  31 
 
 
125 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  31.93 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2676  hypothetical protein  30.89 
 
 
217 aa  41.2  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>