25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5287 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  82.4 
 
 
162 aa  217  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  200  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  40.48 
 
 
172 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  45.45 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  47.56 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  43.18 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  35.9 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  45.68 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  45.68 
 
 
314 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  45.68 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  45.68 
 
 
180 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  45.68 
 
 
178 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  41.46 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  43.9 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  43.9 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  43.9 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  39.02 
 
 
197 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  32.76 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.03 
 
 
179 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  36.47 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  31 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  30.77 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  30.38 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>