31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4888 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  50.94 
 
 		 199 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  44.86 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  49.02 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  37.27 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  38 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  36.63 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  33.02 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  37.5 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  33.7 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  39.78 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  32.99 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  38.71 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  32.61 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  37.5 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  34.69 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  36.73 
 
 		 183 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  37.63 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  37.63 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  32.29 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  30.21 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5457  hypothetical protein  31.9 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  26.73 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  33.98 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  32.29 
 
 		 192 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>