28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4837 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  91.89 
 
 
210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  90.09 
 
 
199 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  47.37 
 
 
138 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  49.02 
 
 
106 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  41.18 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  37.62 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  33.68 
 
 
172 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  33.65 
 
 
171 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  31.31 
 
 
171 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  35.05 
 
 
180 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  35.05 
 
 
180 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  35.05 
 
 
183 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  31.96 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  30.93 
 
 
180 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  30.3 
 
 
171 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  30.93 
 
 
178 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  29.29 
 
 
314 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  30.93 
 
 
178 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  29.29 
 
 
171 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1872  hypothetical protein  32.18 
 
 
190 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  34.78 
 
 
165 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  30.1 
 
 
197 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5457  hypothetical protein  29.75 
 
 
195 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13043  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  31.3 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  32.65 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  30.83 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0178  hypothetical protein  31.31 
 
 
303 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>