15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0011 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  51.4 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0029  hypothetical protein  50.97 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  42.29 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  44.96 
 
 		 209 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  44.19 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  50.43 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0024  hypothetical protein  53.76 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1386  hypothetical protein  38.93 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000111197  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4985  hypothetical protein  34.21 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  33.98 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  33.01 
 
 		 314 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  33.01 
 
 		 171 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  45.24 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1246  hypothetical protein  39.34 
 
 		 179 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>