25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3424 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  274  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  44.86 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  47.37 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  47.66 
 
 		 210 aa  84.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  47.66 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  40.57 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  41.51 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  37.23 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  36.17 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  35.42 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  32.29 
 
 		 314 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  32.38 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  32.26 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  32.26 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  34.69 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  32.26 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  32.26 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  32.26 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  30.21 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  36.14 
 
 		 189 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  31.52 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>