24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1776 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  333  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  39 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  35.56 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  35.38 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  34.62 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  37.08 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  37.37 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  35.35 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  35.71 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  32.41 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  32.71 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  31.78 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  32.71 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  32.71 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  32.71 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  31.31 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  31.68 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0024  hypothetical protein  30.65 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  32.29 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  27 
 
 
106 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  31.52 
 
 
138 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>