37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0257 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  41.21 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  41.73 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  42.65 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  40.94 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  44.14 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  44.12 
 
 		 314 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  45.1 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  42.48 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  44.12 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  42.48 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  42.48 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  42.48 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  40.71 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  35.48 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  39.74 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  37.84 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  38.2 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  38.2 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.77 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  27.16 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  36.97 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  27.04 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  32.29 
 
 		 106 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  31.65 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3023  hypothetical protein  28.69 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  32.65 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  27.5 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  27.5 
 
 		 209 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  29.51 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  31.63 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  31.34 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  30.61 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1386  hypothetical protein  27.07 
 
 		 267 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000111197  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>