13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0007 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  99.52 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0024  hypothetical protein  58.41 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  43.7 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  40.7 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  51.04 
 
 		 184 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0029  hypothetical protein  48.57 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  40.31 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1386  hypothetical protein  38.78 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000111197  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4985  hypothetical protein  36.41 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1246  hypothetical protein  35.96 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188378  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  26.53 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>