23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3157 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  84.16 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  76.03 
 
 		 280 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  61.65 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  35.11 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  37.4 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  36.46 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  37.74 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  37.72 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  38.46 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  36.46 
 
 		 170 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  32.63 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  28.24 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0582  hypothetical protein  30.19 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  39.18 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  31.63 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1246  hypothetical protein  28.24 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  25.66 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  38.2 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>