24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2116 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  72.69 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  64.98 
 
 		 199 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  52.5 
 
 		 196 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  64.02 
 
 		 185 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  53.23 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  53.52 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  52.48 
 
 		 177 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  46.26 
 
 		 179 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  45.38 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  48.65 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  46.36 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  40.82 
 
 		 165 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  32.73 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  30.19 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  36.84 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  32.64 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  32.64 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  31.63 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2676  hypothetical protein  32.11 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  30.2 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  32 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  30.34 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  30.69 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>