36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1143 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  352  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  88.76 
 
 		 178 aa  304  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  34.39 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  26.74 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  33.64 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  29.37 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  33.64 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  29.61 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  34 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  28.99 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  32.86 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  29.19 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  30.43 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  33.1 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  31.72 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  30 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  30 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  30 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  29.01 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  30.99 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  29.87 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  29.87 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  29.87 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  29.87 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  29.87 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  26.83 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  30.14 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  29.14 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  29.19 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  28.7 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1916  hypothetical protein  31.72 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  29.14 
 
 		 174 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  29.56 
 
 		 154 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  25.41 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>